针对您提出的“员工拒绝公司门卫保安检查车辆后备箱会有什么法律后果”这一问题，其直接回复的法律依据主要来自《宪法》和《民法典》。

根据《中华人民共和国宪法》第三十七条规定，公民的人身自由不受侵犯，禁止非法搜查公民的身体及私人财产（后备箱属于私人财产范畴）。若公司保安未经法律授权或员工同意检查后备箱，该行为本身已涉嫌违法，员工拒绝检查是对自身合法权利的维护，无法律后果。同时，《中华人民共和国民法典》第一千零三十二条明确自然人享有隐私权，私密空间（含车辆后备箱）受法律保护，公司无合法依据的检查属于侵害隐私权的行为。因此，在检查行为不合法的前提下，员工拒绝检查无需承担任何法律责任；若检查行为合法（如员工同意），员工拒绝则可能违反双方约定或公司制度，但公司处分需符合法律规定。
针对您提出的“员工拒绝公司门卫保安检查车辆后备箱会有什么法律后果”这一问题，以下是几点实用的行动建议：

1. 核实检查合法性：首先确认公司是否有明确的检查规章制度，该制度是否经民主程序制定并公示，或是否取得员工书面同意。若制度缺失或未获同意，检查行为可能不合法。
2. 保留拒绝检查的证据：若拒绝检查时发生争执，可通过录音、录像或留存目击者联系方式等方式固定证据，证明自己是合法拒绝侵权行为。
3. 与公司沟通协商：主动向公司人力资源部门或管理层反馈，说明拒绝检查的法律依据，要求公司停止非法检查行为，或完善检查制度的合法性。
4. 向劳动监察部门投诉：若公司坚持非法检查并对拒绝的员工作出不当处分，可向当地劳动监察部门投诉，要求公司纠正违法行为。

选择解决方案的重点在于优先通过协商解决，避免与保安直接冲突，同时确保自身行为有法律依据。若您需要更具体的法律指导，欢迎进一步向专业律师咨询。

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